Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms