Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm17Q8JZX4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm17Q8JZX4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms