Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Afg3l2Q8JZQ2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms