Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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LgsnQ8CIX8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LgsnQ8CIX8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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