Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hpf1Q8CFE2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms