Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp27Q8CEG8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp27Q8CEG8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp27Q8CEG8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms