Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc9Q8CDN9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms