Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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