Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Snx22Q8C084 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms