Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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