Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod1Q8BVA4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms