Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms