Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed4Q80WQ9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Zbed4Q80WQ9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed4Q80WQ9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms