Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms