Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc155Q80VJ8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms