Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp3Q7TNH6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms