Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim12Q78RX3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms