Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed3Q78IS1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed3Q78IS1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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