Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Topbp1Q6ZQF0 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms