Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms