Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Tmeff1Q6PFE7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Tmeff1Q6PFE7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmeff1Q6PFE7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms