Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slf2Q6P9P0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms