Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms