Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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