Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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