Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly6eQ64253 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms