Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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SspnQ62147 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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SspnQ62147 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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SspnQ62147 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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SspnQ62147 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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