Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkciQ62074 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkciQ62074 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms