Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MslnQ61468 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MslnQ61468 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms