Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BcanQ61361 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BcanQ61361 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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BcanQ61361 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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BcanQ61361 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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BcanQ61361 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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BcanQ61361 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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BcanQ61361 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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BcanQ61361 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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BcanQ61361 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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BcanQ61361 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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BcanQ61361 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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BcanQ61361 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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BcanQ61361 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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