Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Foxd1Q61345 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd1Q61345 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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