Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms