Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms