Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Traf3Q60803 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms