Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cdkn2dQ60773 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cdkn2dQ60773 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cdkn2dQ60773 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cdkn2dQ60773 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cdkn2dQ60773 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cdkn2dQ60773 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkn2dQ60773 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms