Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms