Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms