Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CttnQ60598 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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