Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Trappc1Q5NCF2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Trappc1Q5NCF2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
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Trappc1Q5NCF2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Trappc1Q5NCF2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Trappc1Q5NCF2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Trappc1Q5NCF2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Trappc1Q5NCF2 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Trappc1Q5NCF2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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