Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ndufaf2Q59J78 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ndufaf2Q59J78 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ndufaf2Q59J78 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufaf2Q59J78 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms