Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrc47Q505F5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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