Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Herc2Q4U2R1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Herc2Q4U2R1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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