Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

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Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dnah12Q3V0Q1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Dnah12Q3V0Q1 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Dnah12Q3V0Q1 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Dnah12Q3V0Q1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Dnah12Q3V0Q1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Dnah12Q3V0Q1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Dnah12Q3V0Q1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Dnah12Q3V0Q1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Dnah12Q3V0Q1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Dnah12Q3V0Q1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Dnah12Q3V0Q1 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms