Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms