Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc114Q3UX62 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms