Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm29609Q3UU56 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm29609Q3UU56 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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