Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rnf40Q3U319 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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