Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim43aQ3TL54 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim43aQ3TL54 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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