Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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