Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Perm1Q149B8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Perm1Q149B8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms